Прочие городские церкви в архитектурном отношении ничего особенного не представляют, хотя некоторые из них довольно богато обставлены и имеют церковные певческие хоры; в большинстве городские церкви маловместительны. Хронологический порядок основания их следующий.
Преображенская церковь ― самая древняя в городе, находится, как уже замечено, на Набережной улице. Она основана первым Оренбургским губернатором И. И. Неплюевым в 1750 году на казенный счет. Церковь однопрестольная, до 1859 года именовалась «летним» и, по народному названию, «золотым» собором (от позлащенных на нем главки и креста); с открытием в том году самостоятельной Оренбургской кафедры обращена была в кафедральный собор, каковым и состояла до 1895 года ― времени освящения нового Казанско-Богородского кафедрального собора.
В Преображенской церкви 27 июля 1891 года Оренбургское духовенство во главе с бывшим архипастырем Макарием, местные военные и гражданские власти встречали Высочайшего Гостя Государя Императора Николая Александровича в бытность Его Наследником престола. В настоящее время Преображенская церковь безприходная, приписана к кафедральному собору и временно передана министерству народного просвещения для некоторых городских училищ.
Введенская церковь ― вторая по времени основания, находится на той же Набережной улице, построена также на казенный счет и тем же губернатором Неплюевым в 1752 году. Церковь эта называлась «зимним», а по народному «зеленым» собором и с 1859 по 1895 год служила, как и Преображенская, кафедральным собором. Главный ее алтарь посвящен празднику Введения во храм Пресвятой Богородицы, приделы во имя Благоверного князя Александра Невского и Алексия человека Божия.
Церковь расписана живописью, в 1891 году Св. Синодом обращена в приходскую.
Георгиевский войсковой собор.
Георгиевский войсковой собор ― бывшая Георгиевская церковь в казачьем Форштадте, основана Неплюевым в 1756 году. В ней всего один престол во имя великомученика Георгия. Во время пугачевского бунта в 1773 году церковь была расхищена. По преданию, здесь самозванец в доказательство царского своего достоинства кощунственно садился на св. престол. В 1791 году церковь освящена вновь, а в 1891 году обращена в Оренбургский войсковой собор.
Троицкая церковь (на Троицкой улице) ― трехпрестольная, основана на казенный счет в 1774 году в память освобождения города Оренбурга от долговременной и тяжкой осады скопищами Пугачева. Троицкая церковь дважды подвергалась пожарам. Ныне она благолепно обставлена. Кроме главного престола во имя Пресвятой Троицы, в церкви имеются приделы в честь Успения Богоматери и св. Николая чудотворца.
Вознесенская церковь (купеческая) ― трехпрестольная, стоит на Николаевской улице, основана на казенный счет в 1784 году. Под церковью устроен был проезд в гостиный двор. В 1845 году церковь увеличена. Ныне, поддерживаемая местным купечеством, она благолепна. Главный ее алтарь посвящен празднику Вознесения Господня, приделы ― в честь Благовещения Пресвятой Богородицы и святителя Николая.
Военно-Петропавловская церковь, расположенная на улице того же названия, устроена также на казенный счет первоначально в 1757 году для местных войск, затем сгорела и возобновлена в 1809 году. Кроме главного алтаря в честь Св. апостолов Петра и Павла, в церкви имеется придел во имя Воздвижения Креста Господня.
Кладбищенская церковь (близ женского монастыря) ― однопрестольная во имя Смоленской иконы Богоматери, приписана к кафедральному собору. Устроена она по Высочайше утвержденному плану в 1847 году на средства чиновника А. Еникуцева. Строитель, кроме того, оставил церкви 34.667 руб. с тем, чтобы капитал этот, обращаясь в кредитных учреждениях, оставался неприкосновенным в течение 100 лет. При благоприятных обстоятельствах означенный капитал имеет возрасти в миллион рублей, после чего, согласно завещанию, церковь должна быть приведена в более благоприличный вид, с учреждением при ней трехштатного причта, вполне обеспеченного, и лучшего певческого хора. Прах Еникуцева покоится в склепе под полом той церкви.
Покровская церковь ― трехпрестольная, в Старой слободке, устроена в 1853 году на средства почетного гражданина М. С. Деева. В ней главный престол ― во имя Покрова Пресвятой Богородицы, приделы ― в честь Св. Архангела Михаила и преподобного Сергия Радонежского чудотворца.
Воскресенская церковь ― трехпрестольная, в Новой слободке, основана на средства вдовы полкового командира Т. И. Приезжевой в 1856 году. В ней главный престол в честь Воскресения Христова, празднуемый в первый после Св. Пасхи воскресный день (неделя о Фоме), приделы ― в честь Казанской иконы Богоматери и Николая чудотворца.
Никольская церковь в казачьем Форштадте.
Никольская церковь ― трехпрестольная, в казачьем Форштадте, довольно обширная и светлая, основана в 1886 году на средства прихожан ― казаков. Главный ее престол ― в честь святителя Николая чудотворца. Приделы во имя Св. великомученика Пантелеймона и Успения Богоматери.
Димитриевская ― трехпрестольная, в Новой слободке, устроена иждивением братьев купцов Д. и О. Дегтяревых в 1890 году. Главный престол ― в честь Св. Димитрия Солунского, приделы ― во имя Св. Троицы и Успения Богоматери.
Знаменская единоверческая во имя знамения Пресвятой Богородицы ― однопрестольная, на Деевской площади. Основана на средства купца М. Пупышева в 1892 году. При церкви имеется единоверческая церковно-приходская школа.
Пантелеймоновская в честь Св. великомученника Пантелеймона ― деревянная, миниатюрная, в зауральной роще, устроена в 1893 году средствами дачников для удовлетворения их религиозных нужд в летнее время.
Михайло-Архангелъская ― трехпрестольная, на Мариинской площади в Новой слободке, устроенная на средства добровольных пожертвований в 1902 году. Главный в ней престол ― в честь Св. Архангела Михаила, приделы ― в честь Николая чудотворца и Св. равноапостольной Марии Магдалины.
Иоанно-Богословская ― в той же Новой слободке, устроена в 1902 году главным образом на средства чиновника Истомина и заштатного протоиерея Семенова.
Воскресенская ― кладбищенская, деревянная, на военном кладбище, приписанная к домовой церкви военного лазарета. Устроена в 1901 году.
Николаевская ― на Николаевской площади в Новой слободке, устроена на средства прихожан в 1909 году.
Серафимовская в честь Св. Серафима Саровского ― деревянная, в казачьем Форштадте, освящена в 1912 году.
Захарие-Елисаветинская ― загородная, на меновом дворе. Время сооружения ее относится к 1757 году. Но, по некоторым сведениям, церковь на меновом дворе существует в том или другом виде со времени устройства того двора. Служба в ней совершается только в летнее время.
Кроме поименованных, в Оренбурге имеется до 20 домовых церквей. Сюда относятся: Крестовая при архиерейском доме, две церкви в зданиях духовного училища, духовной семинарии, епархиального училища, кадетских корпусов, казачьего военного училища, первой женской и мужской гимназий, Николаевского женского института, реального училища, военного лазарета, губернской тюрьмы, губернской больницы, богодельни для привилегированных сословий, приюта Св. Ольги и в лагерях кадетских корпусов.